Caso o gestor responsável técnico que gerou as chaves de acesso das aplicações se desligue do órgão, as chaves de acesso deixam de funcionar?

Não. Para que não haja interrupção dos sistemas não serão desabilitadas as chaves mas recomenda-se que o órgão solicite a desativação do gestor na plataforma e proceda a substituição das chaves assim que possível.